1、学校决策层——科技园管理委员会
　　科技园管理委员会，由学校校长、分管副校长和有关职能部门负责人等组成。管委会的主要职责是宏观指导科技园建设，制定科技园发展战略，协调有关单位给予支持，营造科技园发展的良好环境，对科技园建设和运行中的重大问题进行决策。
　　2、园区运营层——科技园服务中心和江西赣师科技发展有限公司
　　学校在科技园设立运作层。由“赣南师范学院科技园服务中心”和“江西赣师科技发展有限公司”组成。科技园服务中心既是管委会常设办事机构，也是学校的业务部门，其主要职责是代表学校在园区行使行政管理职能，处理管委会的日常事务，协调校内外各种资源为园区企业服务，管理学校的科技创新创业企业，帮助在校学生创新创业。具体负责科技园的发展规划工作，协调和落实对科技园内企业的各项优惠政策，保证科技园顺利运行。下设综合管理部、事业发展部和企业孵化部。
   江西赣师科技发展有限公司是具有独立法人资格的园区专业化管理机构，注册资本1000万元人民币（赣南师范大学独资）。公司主要负责科技园的开发、经营和管理。公司对外行使法人职能，推行现代企业管理模式，为入园企业、科研机构和创业者提供全方位、全过程的优质服务。其主要职能包括：一是孵化企业、孵化技术、孵化人才；二是经营管理学校在科技园的有形、无形资产；三是科技成果转化与科技项目合作开发；四是技术服务和技术咨询;五是文化传承创新。